เสริมประสิทธิภาพในการวิเคราะห์โปรตีน ด้วยการเลือกใช้ปิเปตแบบหลายช่อง Enhancing the Efficiency of Protein Folding Analysis by Using Multichannel Pipettes

By:   บริษัท เมทเล่อร์-โทเลโด (ประเทศไทย) จำกัด
MT-TH.CustomerSupport@mt.com

   ในห้องปฏิบัติการ การผลิตโปรตีนโดยการจัดโครงสร้างใหม่เป็นเรื่องที่ท้าทาย เพราะต้องมีผลการทดสอบที่ชัดเจนและมีความพยายามในการทดลองอย่างต่อเนื่อง โดยวิธีการทดสอบหาความคงตัวของโปรตีน ที่เรียกว่าวิธี Differential Scanning Fluorimetry (DSF) หรือ DSF Guided Refolding (DGR) สามารถกำหนดและปรับสภาวะการทดสอบให้เหมาะสมเพื่อที่จะปรับโครงสร้างโปรตีนได้อย่างรวดเร็วและมีปริมาณสูง

การจัดโครงสร้างของโปรตีนด้วยวิธี DSF Guided Refolding (DGR)

   เพื่อให้ได้ข้อมูลที่ถูกต้องจากกระบวนการ DGR นักวิจัยจำเป็นต้องมีการจัดเตรียมตัวอย่างด้วยความรวดเร็วและระมัดระวัง ในส่วนของกระบวนการ DGR ที่ต้องอาศัยฟลูออเรสเซนส์ด้วยการย้อมสีส้มa ที่มีความไวต่อแสงนั้น การใช้ปิเปตแบบช่องเดียวต้องใช้เวลาถึง 10 นาที สำหรับจานแบบ 96 หลุม และยังได้รับข้อมูลที่อาจไม่สอดคล้องกัน เนื่องจากสัญญาณจากสีย้อมสีส้มaนั้นจะค่อยๆ ซีดจางลงไป จึงต้องการพัฒนาวิธีการทดลองในครั้งนี้ และหากมีการนำปิเปตแบบหลายช่องมาใช้ในการทำงานจะช่วยเพิ่มรอบการทำงานได้ โดยปัจจุบัน พบว่าเครื่องมือที่ใช้อยู่นั้น ทำให้ผู้ใช้งานเกิดความความเมื่อยล้าและเสี่ยงต่อการบาดเจ็บจากการใช้งานปิเปตที่ต้องมีการดูดตัวอย่างซ้ำหลายครั้ง ยิ่งไปกว่านั้น นักวิจัยยังต้องกังวลเกี่ยวกับการวัดปริมาตรที่ไม่แน่นอน หากต้องใช้งานปิเปตในการดูดสารอย่างต่อเนื่องและมีโอกาสสูญเสียตัวอย่างจากปลายทิปของปิเปตอีกด้วย คุณมาร์ก ลี จึงได้ปรึกษาตัวแทนจากบริษัทผู้เชี่ยวชาญด้านเครื่องมือห้องปฏิบัติการb เพื่อหาทางออกให้ปัญหาดังกล่าว ซึ่งนักวิจัยในห้องปฏิบัติการนี้คุ้นเคยกับปิเปตแบบช่องเดียวและเทคโนโลยีที่ทันสมัยc ของบริษัทผู้เชี่ยวชาญนี้อยู่แล้ว จึงตัดสินใจทดลองใช้ปิเปตแบบหลายช่องd ในการวิเคราะห์ตัวอย่างและพบว่าเทคโนโลยีนี้c ทำให้ใช้งานได้อย่างสะดวกและได้ผลการทดลองที่มีความแม่นยำสูง โดยปิเปตแบบหลายช่องd สามารถเพิ่มรอบการทำงานและได้ชุดข้อมูลที่มีคุณภาพสูง อีกทั้งยังช่วยลดความเมื่อยล้าจากการปิเปตได้อีกด้วย

   In the laboratory, protein production by refolding is challenging because suitable refolding conditions must be empirically determined for each protein and can be painstaking. Measuring a variety of protein stability, that differential scanning fluorimetry (DSF), and their assays, termed DSF guided refolding (DGR), can be used to determine and optimize conditions that favor proper protein folding in a rapid and high-throughput fashion.

DSF Guided Refolding (DGR) Method

   For accurate data, DGR assays must be prepared quickly and carefully. DGR relies on fluorescence from the light-sensitive compound orangea. Mr. Lee described the lab’s attempts to refine their experiments. Using single-channel pipettes consumed 10 minutes per 96-well plate and produced inconsistent data due to fading of the orangea signal. Multichannel pipettes improved throughput, but the lab’s existing instruments caused user fatigue and risked repetitive strain injuries. Moreover, researchers were concerned about the repeatability from tip to tip of the volumes aspirated and sample loss when tips fell off. So, Mr. Lee discussed options with the expert lab’s representativeb to find out the right solution. Familiar with their single-channel pipettes and modern technologyc, the lab chose to demo these multichannel pipettesd for their assays. They immediately noticed the more comfortable pipetting experience and the high-quality data provided by modern technologyc. Confident that these multichannel pipettesd would improve throughput and data quality and diminish the risk of injuries.